南康区财政局是区政府主管财政工作的工作部门。内设办公室、预算股、国库股、行政政法股、教科文股、经济建设股、农业农村股、社会保障股、债务金融股、基本建设股、政府采购监管办公室、综合规划股、会计股和监督评价股等机构。